Les changements climatiques constituent aujourd’hui une pression supplémentaire qui menace la diversité biologique. Ces changements climatiques, et en particulier l’élévation des températures, ont une incidence sur les périodes de reproduction et/ou la migration de certaines espèces, la durée des phases de croissance, la fréquence des infestations parasitaires et l’apparition de nouvelles maladies. Les changements prévus risquent donc d’engendrer des modifications de la répartition des espèces et des densités de populations, par un déplacement des habitats (e.g. migration vers le pôle ou en altitude pour les espèces à affinités froides). Ainsi un changement de la composition de la majorité des écosystèmes actuels est probable. De même les risques d’extinction d’espèces, et en particulier celles déjà vulnérables, sont de nature à augmenter significativement, en particulier pour les espèces dont l’aire de répartition climatique est restreinte, celles qui ont des besoins très spécifiques en matière d’habitat et/ou les petites populations naturellement plus vulnérables face à une modification de leurs habitats. Enfin l’introduction de nouvelles espèces exotiques pourrait être facilitée, phénomène dont les conséquences à long terme sont difficiles à prévoir.

Pour protéger la biodiversité marine et les services rendus par les océans, la France a choisi de mener une politique volontariste de création d’aires marines protégées dans toutes ses eaux, métropolitaines et ultra-marines. Ces aires marines protégées sont organisées en réseaux connectés et doivent être efficacement gérées pour maintenir les océans en bonne santé et garantir leur résilience à long-terme, c’est-à-dire leur capacité à retrouver leurs fonctions après une perturbation.

Les simulations MedCORDEX pour la Méditerranée permettent des études plus précises et plus détaillées des scénarios d'évolution du climat du bassin Méditerranéen et son adaptées pour le forçage de modèles et d'outils diagnostiques pour les écosystèmes marins. Cependant, ces outils de modélisation des écosystèmes marins pour produire des scénarios et évaluer les impacts du changement climatique et des pressions atmosphériques sur le fonctionnement de l'écosystème marin, la biodiversité et les ressources marines sont encore à consolider, ou pour certains même à développer.